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title: 运行和验证
description: "1. 使用PuTTY工具，以root用户登录服务器。"
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# 运行和验证

#### 操作步骤

1. 使用PuTTY工具，以root用户登录服务器。
2. 执行以下命令进入“pal2nal”目录

```
cd /path/to/PAL2NAL/pal2nal.v14
```


3. 执行以下命令验证。

```
./pal2nal.pl  test.aln  test.nuc  -output paml  -nogap  >  for_paml/test.codon
```


  程序正常运行。