---
title: 运行和验证
description: "1. 使用PuTTY工具，以root用户登录服务器。"
url: https://www.hikunpeng.com/document/detail/zh/kunpenghpcs/hpcindapp/prtg-osc/kunpengpblat_02_0007.html
sourcePath: /source/zh/kunpenghpcs/hpcindapp/prtg-osc/kunpengpblat_02_0007.html
indexId: 6fd30e7ce0b6f77fb2d71cba93cd67be54090d37d3a4202701bec651792de9f967
---
# 运行和验证

#### 操作步骤

1. 使用PuTTY工具，以root用户登录服务器。
2. 执行以下命令建立算例文件夹，并复制算例文件。

```
mkdir
/path/to/PBLAT/test
cp
hg19.fa.gz
/path/to/PBLAT/test
cp
NONCODEv5_human.fa.gz
/path/to/PBLAT/test
```


3. 执行以下命令进入算例目录。

```
cd
/path/to/PBLAT/test
```


4. 执行以下命令处理算例文件。

```
gzip -d
hg19.fa.gz
gzip
-d
NONCODEv5_human.fa.gz
cat
NONCODEv5_human.fa
|
grep -v "^#" | head -799996 > test-799996.fa
```


5. 执行以下命令进行测试。

```
{ time pblat -threads=96 hg19.fa test-799996.fa out.psl ; } 2>&1 |tee pblat-kunpeng.log
```


  需要查看“pblat-kunpeng.log”日志中的“real”数值，单位是“s”，数值越小性能越优。

  输出的结果样例如图1所示。

  图1 结果样例