---
title: 介绍
description: "PhyloPhlAn是一个集成管道，用于对基因组和宏基因组进行大规模系统发育分析。PhyloPhlAn是一种准确、快速且易于使用的方法，用于在多个分辨率级别进行大规模微生物基因组表征和系统发育分析。PhyloPhlAn可以将基因组和宏基因组组装基因组（MAG）分配到物种级基因组箱（SGB）。PhyloPhlAn可以使用进化枝特异性的最大信息系统发育标记重建菌株水平的系统发育，并且还可以扩展到包含超过17000个微生物物种的非常大的系统发育。"
url: https://www.hikunpeng.com/document/detail/zh/kunpenghpcs/hpcindapp/prtg-osc/kunpengphylophlan_02_0001.html
sourcePath: /source/zh/kunpenghpcs/hpcindapp/prtg-osc/kunpengphylophlan_02_0001.html
indexId: d7d39e070d340358a4e4c044265a7dc523d0c3bd6e395bcd40c97fb9f8488b4072
---
# 介绍

PhyloPhlAn是一个集成管道，用于对基因组和宏基因组进行大规模系统发育分析。PhyloPhlAn是一种准确、快速且易于使用的方法，用于在多个分辨率级别进行大规模微生物基因组表征和系统发育分析。PhyloPhlAn可以将基因组和宏基因组组装基因组（MAG）分配到物种级基因组箱（SGB）。PhyloPhlAn可以使用进化枝特异性的最大信息系统发育标记重建菌株水平的系统发育，并且还可以扩展到包含超过17000个微生物物种的非常大的系统发育。

关于PhyloPhlAn的更多信息请访问PhyloPhlAn官网(https://huttenhower.sph.harvard.edu/phylophlan/)。

语言：Python、Perl。

一句话描述：PhyloPhlAn是一个集成管道，用于对基因组和宏基因组进行大规模系统发育分析。。

开源协议：MIT License。

#### 建议的版本

建议使用的版本为“PhyloPhlAn 3.0.60”。