---
title: 编译和安装
description: "1. 使用PuTTY工具，以root用户登录服务器。"
url: https://www.hikunpeng.com/document/detail/zh/kunpenghpcs/hpcindapp/prtg-osc/kunpengpsipred_02_0008.html
sourcePath: /source/zh/kunpenghpcs/hpcindapp/prtg-osc/kunpengpsipred_02_0008.html
indexId: f9367861c805d7219f1316aa775273b43e2a1c88eb52d28c51a25c782211512469
---
# 编译和安装

#### 操作步骤

1. 使用PuTTY工具，以root用户登录服务器。
2. 执行以下命令进入源码包目录。

```
cd
/path/to/psipred
```


3. 执行以下命令解压安装包并进入解压后的目录。

```
tar xvf v4.0.tar.gz
cd psipred-4.0/src
```


4. 执行以下命令进行编译。

```
make -j
make install
```


5. 执行以下命令进入解压目录。

```
cd ../BLAST+
```


6. 执行以下命令新建并进入数据库目录。

```
mkdir database && cd database
```


7. 执行以下命令下载并使用数据库。

```
wget http://ftp.ncbi.nih.gov/blast/db/FASTA/swissprot.gz
gunzip swissprot.gz
makeblastdb -dbtype prot -in swissprot -out swissprot
```


8. 执行以下命令修改运行文件。

  a. 打开“runpsipredplus”文件。

```
cd ..
vim runpsipredplus
```


  b. 按“i”进入编辑模式，将第14、17行修改成以下内容。

```
set dbname =
/path/to/psipred-4.0
/BLAST+/database/swissprot
set ncbidir =
/path/to/blast+
/ncbi-blast-2.13.0+-src/c++/ReleaseMT/bin
```


  c. 按“Esc”键，输入:wq!，按“Enter”保存并退出编辑。
