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title: 编译和安装
description: "1. 使用PuTTY工具，以root用户登录服务器。"
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# 编译和安装

#### 操作步骤

1. 使用PuTTY工具，以root用户登录服务器。
2. 执行以下命令创建conda环境安装相关依赖。

```
conda create --name pyem --clone base
conda activate pyem
```


3. 执行以下命令安装FFTW依赖。

```
yum install fftw3 --installroot=/root/anaconda3/envs/pyem/lib/python3.8/site-packages
wget http://fftw.org/fftw-3.3.8.tar.gz
tar xvf fftw-3.3.8.tar.gz
cd fftw-3.3.8
./configure --prefix=/root/anaconda3/envs/pyem/lib/python3.8/site-packages/FFTW --enable-shared --enable-static --enable-fma --enable-neon
make -j 32
make install
pip3 install pyfftw --trusted-host mirrors.tools.huawei.com -i http://mirrors.tools.huawei.com/pypi/simple
```


4. 执行以下命令安装healpy、pathos、natsort、numpy依赖。

```
conda update --all
conda install -c conda-forge healpy pathos
conda install natsort numpy==1.20.1
```


5. 执行以下命令解压pyem安装包。

```
tar xvf pyem-0.5.tar.gz
```


6. 执行以下命令进入解压后目录。

```
cd pyem-0.5
```


7. 执行以下命令安装pyem。

```
pip3 install --no-dependencies -e .
```


  安装成功后提示“Successfully installed pyem”。

8. 执行以下命令修改“projection_subtraction.py”文件。

  a. 打开“projection_subtraction.py”文件。

```
vi projection_subtraction.py
```


  b. 按“i”进入编辑模式，删除第291行中的version="projection_subtraction.py 2.1b"。
    修改前：

```
291 parser = argparse.ArgumentParser(version="projection_subtraction.py 2.1b")
```


    修改后：

```
291 parser = argparse.ArgumentParser()
```


    执行8.a之后，按“Esc”键，输入“:set nu”，按“Enter”即可显示出行号。

  c. 按“Esc”键，输入:wq!，按“Enter”保存并退出编辑。