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title: 安装CTFFIND
description: "1. 使用PuTTY工具，以root用户登录服务器。"
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# 安装CTFFIND

#### 操作步骤

1. 使用PuTTY工具，以root用户登录服务器。
2. 执行以下命令获取CTFFIND安装包。

```
wget https://grigoriefflab.umassmed.edu/system/tdf?path=ctffind-4.1.14.tar.gz&file=1&type=node&id=26
```


3. 执行以下命令解压CTFFIND安装包。

```
tar -zxvf  ctffind-4.1.14.tar.gz
```


4. 执行以下命令进入解压后的目录。

```
cd ctffind-4.1.14
```


5. 执行以下命令修改“src/core/matrix.cpp”文件。

  a. 打开“src/core/matrix.cpp”文件。

```
vi src/core/matrix.cpp
```


  b. 按“i”进入编辑模式，修改第7行的内容。
    修改前：

```
7  #define _AL_SINCOS(x, s, c)  __asm__ ("fsincos" : "=t" (c), "=u" (s) : "0" (x))
```


    修改后：

```
7 #define _AL_SINCOS(x, s, c)   s = sinf(x);  c = cosf(x);
```


    执行5.a之后，按“Esc”键，输入“:set nu”，按“Enter”即可显示出行号。

  c. 按“Esc”键，输入:wq!，按“Enter”保存并退出编辑。
6. 执行以下命令进行编译安装。

```
yum install -y libjpeg* libtiff* fftw*
autoreconf -f -i
./configure --prefix=
/path/to/ctffind
--disable-mkl --enable-openmp --enable-debugmode
```


7. 执行以下命令修改“Makefile”文件。

  a. 打开“Makefile”文件。

```
vi Makefile
```


  b. 按“i”进入编辑模式，将CFLAGS CPPFLAGS CXXFLAGS中的-O2修改为-O0。
    修改前：

```
296 CFLAGS = -g -O2
297 CPP = clang -E
298 CPPFLAGS = -O2 -g -D_FILE_OFFSET_BITS=64 -D_LARGEFILE_SOURCE -DDEBUG
299 CXX = clang++
300 CXXCPP = clang++ -E
301 CXXDEPMODE = depmode=gcc3
302 CXXFLAGS = -O2 -g -D_FILE_OFFSET_BITS=64 -D_LARGEFILE_SOURCE -DDEBUG  -fopenmp
```


    修改后：

```
296 CFLAGS = -g –O0
297 CPP = clang -E
298 CPPFLAGS = -O0 -g -D_FILE_OFFSET_BITS=64 -D_LARGEFILE_SOURCE -DDEBUG
299 CXX = clang++
300 CXXCPP = clang++ -E
301 CXXDEPMODE = depmode=gcc3
302 CXXFLAGS = -O0 -g -D_FILE_OFFSET_BITS=64 -D_LARGEFILE_SOURCE -DDEBUG  -fopenmp
```


  c. 按“Esc”键，输入:wq!，按“Enter”保存并退出编辑。
8. 执行以下命令进行编译安装。

```
make & make install
```


9. 执行以下命令配置环境变量。

```
export PATH=
/path/to/install/ctffind
/bin:$PATH
```