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title: 编译和安装
description: "1. 使用PuTTY工具，以root用户登录服务器。"
url: https://www.hikunpeng.com/document/detail/zh/kunpenghpcs/hpcindapp/prtg-osc/kunpengsoapdenovo_02_0006.html
sourcePath: /source/zh/kunpenghpcs/hpcindapp/prtg-osc/kunpengsoapdenovo_02_0006.html
indexId: e8525c8ea0fb929f3c0be7bd6c6f6296ea8952f0ebb595b1eeea45e9dccfbfca72
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# 编译和安装

#### 操作步骤

1. 使用PuTTY工具，以root用户登录服务器。
2. 执行以下命令进入“SOAPDENOVO”目录。

```
cd
/path/to/SOAPDENOVO
```


3. 执行以下命令解压“SOAPdenovo2-r241.tar.gz”。

```
tar -
xvf SOAPdenovo2-r241.tar.gz
```


4. 执行以下命令进入解压后的目录。

```
cd SOAPdenovo2-r241
```


5. 执行以下命令修改“standardPregraph/hashFunction.c”文件。

  a. 打开“standardPregraph/hashFunction.c”文件。

```
vi standardPregraph/hashFunction.c
```


  b. 按“i”进入编辑模式，修改如下内容。
    修改前：

```
static uint32_t cpuid ( uint32_t functionInput )
{
uint32_t eax;
uint32_t ebx;
uint32_t ecx;
uint32_t edx;
#ifdef __PIC__
asm ( "pushl %%ebx\n\t" /* save %ebx */
"cpuid\n\t"
"movl %%ebx, %[ebx]\n\t" /* save what cpuid just put in %ebx */
"popl %%ebx" : "=a" ( eax ), [ebx] "=r" ( ebx ), "=c" ( ecx ), "=d" ( edx ) : "a" ( functionInput )
: "cc" );
#else
asm ( "cpuid" : "=a" ( eax ), "=b" ( ebx ), "=c" ( ecx ), "=d" ( edx ) : "a" ( functionInput ) );
#endif
return ecx;
}
```


    修改后：

```
static uint32_t cpuid ( uint32_t functionInput )
{
uint32_t eax;
uint32_t ebx;
uint32_t ecx;
uint32_t edx;
#ifdef __aarch64__
ecx = 0x0;
#else
#ifdef __PIC__
asm ( "pushl %%ebx\n\t" /* save %ebx */
"cpuid\n\t"
"movl %%ebx, %[ebx]\n\t" /* save what cpuid just put in %ebx */
"popl %%ebx" : "=a" ( eax ), [ebx] "=r" ( ebx ), "=c" ( ecx ), "=d" ( edx ) : "a" ( functionInput )
: "cc" );
#else
asm ( "cpuid" : "=a" ( eax ), "=b" ( ebx ), "=c" ( ecx ), "=d" ( edx ) : "a" ( functionInput ) );
#endif
return ecx;
}
```


  c. 按“Esc”键，输入:wq!，按“Enter”保存并退出编辑。
6. 执行以下命令安装samtools。

```
yum install samtools
```


7. 执行以下命令开始编译。

```
make
```


8. 执行以下命令测试SOAPdenovo环境。

```
./SOAPdenovo-63mer
```


  回显显示如下信息，表示环境正常。