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title: 介绍
description: "TopHat2是一个快速的将RNA-Seq数据进行快速剪接映射的程序，它使用超快的高通量短读比对程序，将RNA-Seq的信息比对到哺乳动物大小基因组上，然后分析映射结果来鉴别外显子之间的剪接点。TopHat是马里兰大学生物信息和计算机生物中心、加利福尼亚大学伯克利分校数学系和分子细胞生物学系和哈弗大学的干细胞与再生生物学系联合开发的结果。"
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# 介绍

TopHat2是一个快速的将RNA-Seq数据进行快速剪接映射的程序，它使用超快的高通量短读比对程序，将RNA-Seq的信息比对到哺乳动物大小基因组上，然后分析映射结果来鉴别外显子之间的剪接点。TopHat是马里兰大学生物信息和计算机生物中心、加利福尼亚大学伯克利分校数学系和分子细胞生物学系和哈弗大学的干细胞与再生生物学系联合开发的结果。

关于TopHat2的更多信息请访问TopHat2官网(http://ccb.jhu.edu/software/tophat/manual.shtml)。

语言：C语言。

一句话描述：一个快速的将RNA-Seq数据进行快速剪接映射的程序。

开源协议：Boost Software License 1.0。

#### 建议的版本

建议使用的版本为“TopHat2 2.1.1”。