---
title: 介绍
description: "CD-HIT是一种非常广泛使用的程序，用于聚类和比较蛋白质或核苷酸序列。CD-HIT最初由伯纳姆研究所（现为Sanford-Burnham医学研究所）的Adam Godzik博士实验室的李伟中博士开发。"
url: https://www.hikunpeng.com/document/detail/zh/kunpenghpcs/hpcindapp/prtg-osc/kylin_kunpeng_cdhit_481_02_0001.html
sourcePath: /source/zh/kunpenghpcs/hpcindapp/prtg-osc/kylin_kunpeng_cdhit_481_02_0001.html
indexId: e7b9c1d389b752f1b47d8b27f00e07a3f305d9f2ddaedb208d0cae9271fa7e5b78
---
# 介绍

CD-HIT是一种非常广泛使用的程序，用于聚类和比较蛋白质或核苷酸序列。CD-HIT最初由伯纳姆研究所（现为Sanford-Burnham医学研究所）的Adam Godzik博士实验室的李伟中博士开发。

CD-HIT速度非常快，可以处理非常大的数据库。CD-HIT有助于显着减少许多序列分析任务中的计算和手动工作，并有助于理解数据结构和纠正数据集中的偏差。

CD-HIT包有CD-HIT、CD-HIT-2D、CD-HIT-EST、CD-HIT-EST-2D、CD-HIT-454、CD-HIT-PARA、PSI-CD-HIT、CD-HIT-OTU、CD-HIT-LAP、CD-HIT-DUP和十几个脚本。

开发语言：Python。

一句话描述：CD-HIT是一款用于聚类和比较蛋白质或核苷酸序列的工具。

#### 建议的版本

建议使用版本为“CDHIT-4.8.1”。