--- title: 编译和安装 description: "1. 使用PuTTY工具，以root用户登录服务器。" url: https://www.hikunpeng.com/document/detail/zh/kunpenghpcs/hpcindapp/prtg-osc/kylin_kunpeng_fvcom_41_02_0013.html sourcePath: /source/zh/kunpenghpcs/hpcindapp/prtg-osc/kylin_kunpeng_fvcom_41_02_0013.html indexId: f3f2a06ffd1e4550c70be6e49d1d2405525ca875667b1918ea4923af187124a877 --- # 编译和安装 #### 操作步骤 1. 使用PuTTY工具，以root用户登录服务器。 2. 执行以下命令进入FVCOM目录。 ``` cd /path/to/ FVCOM ``` 3. 执行以下命令解压并编辑配置文件。 ``` tar -xvf fvcom-4.1.tar.gz cd FVCOM4.1 ``` 4. 配置相关文件。 - 执行以下命令复制“make.inc_example”文件为“make.inc”。 ``` cp Examples/Estuary/make.inc_example FVCOM_source/make.inc ``` - 执行以下命令创建“make.inc”文件软链接。 ``` l n -sf FVCOM_source/make.inc ./ ``` - 执行以下命令编辑“make.inc”文件。 ``` vim make.inc ``` 按“i”进入编辑模式，修改以下内容。 第51行。 ``` TOPDIR = /path/to/FVCOM/FVCOM4.1/FVCOM_source ``` 第79、80行。 ``` LIBDIR = -L$(INSTALLDIR)/lib -L../METIS_source/metis -L./libs/julian INCDIR = -I$(INSTALLDIR)/include -I../METIS_source/metis -I./libs/julian ``` 第97行。 ``` IOLIBS = -L/path/to/NETCDF/lib -L/path/to/HDF5/lib -lnetcdff -lnetcdf -lhdf5_hl -lhdf5 -lz -lcurl -lm ``` 第98行。 ``` IOINCS = -I/path/to/NETCDF/include -I/path/to/HDF5/include ``` 找到并注释掉并添加以下内容。 ``` # Intel/MPI Compiler Definitions (SMAST) #-------------------------------------------------------------------------- # CPP = /usr/bin/cpp # COMPILER = -DIFORT # CC = mpicc # CXX = mpicxx # CFLAGS = -O3 # FC = mpif90 # DEBFLGS = -check all traceback # Use 'OPT = -O0 -g' for fast compile to test the make # Use 'OPT = -xP' for fast run on em64t (Hydra and Guppy) # Use 'OPT = -xN' for fast run on ia32 (Salmon and Minke) # OPT = -O0 –g # OPT = -axN –xN # OPT = -O3 # gfortran defs #-------------------------------------------------------------------------- CPP = /usr/bin/cpp COMPILER = -DGFORTRAN CC = mpicc CXX = mpicxx FC = mpif90 DEBFLGS = OPT = -O3 -ffixed-line-length-none -ffree-form -ffree-line-length-none CLIB = ``` 按“Esc”键，输入:wq!，按“Enter”保存并退出编辑。 5. 执行以下命令创建编译环境变量文件。 ``` vim env-fvcom.sh ``` 按“i”进入编辑模式，添加如下内容。 ``` export GCC_HOME= /path/to/GNU export PATH=$GCC_HOME/bin:$PATH export LD_LIBRARY_PATH=$GCC_HOME/lib:$GCC_HOME/lib64:$LD_LIBRARY_PATH export MPI_HOME= /path/to/OPENMPI export PATH=$MPI_HOME/bin:$PATH export LD_LIBRARY_PATH=$MPI_HOME/lib:$LD_LIBRARY_PATH export HDF5= /path/to/HDF5/install export PATH=$HDF5/bin:$PATH export LD_LIBRARY_PATH=$HDF5/lib:$LD_LIBRARY_PATH export NETCDF= /path/to/NETCDF export PATH=$NETCDF/bin:$PATH export LD_LIBRARY_PATH=$NETCDF/lib:$LD_LIBRARY_PATH ``` 按“Esc”键，输入:wq!，按“Enter”保存并退出编辑。 6. 执行以下命令加载环境变量。 ``` source env-fvcom.sh ``` 7. 执行以下命令编辑“mod_newinp.F”文件。 ``` vim mod_newinp.F ``` 按“i”进入编辑模式。 第一个“contains”语句下修改和添加以下内容。 ``` !---------------------------------------- ! functions !---------------------------------------- contains Character( Len = 256 ) Function N_Fmt( c , n ) Character( Len = * ) , Intent( IN ) :: c Integer , Intent( IN ) :: n integer :: i , j character( len = 16 ) :: cn i = index( c , '<' ) j = index( c , '>' ) write( cn , '(g0)' ) n N_Fmt = c(:i-1) // Trim(adjustL(cn)) // c(j+1:) End Function N_Fmt ``` 按“Esc”键，输入:wq!，按“Enter”保存并退出编辑。 8. 执行以下命令修改第352、421、494、567行的内容。 第352行。 ``` write(*,N_Fmt('(A20,F10.4)',SIZE))trim(argname)//': ',fval(1:SIZE) ``` 第421行。 ``` write(*,N_Fmt('(A20,I10)',SIZE))trim(argname)//': ',ival(1:SIZE) ``` 第494行。 ``` write(*,N_Fmt('(A20,L10)',SIZE))trim(argname)//': ',cval(1:SIZE) ``` 第567行。 ``` write(*,N_Fmt('(A20,A10)',SIZE))trim(argname)//': ',sval(1:SIZE) ``` 按“Esc”键，输入:wq!，按“Enter”保存并退出编辑。 9. 执行以下命令修改“mod_scal.F”、“internal_step.F”、“adv_t.F”、“adv_s.F”文件，对文件中以“IF(BACKWARD_ADVECTION”开头的语句进行相应修改，修改“==”为“.eqv.”，修改“/=”为“.neqv”。 ``` sed -i 's/\/=\.TRUE\./\.neqv\.\.TRUE\./g' mod_scal.F sed -i 's/==\.TRUE/\.eqv\.\.TRUE/g' internal_step.F sed -i 's/==\.FALSE\./\.eqv\.\.FALSE\./g' adv_t.F sed -i 's/==\.FALSE\./\.eqv\.\.FALSE\./g' adv_s.F ``` 10. 执行以下命令编辑“mod_utils.F”文件。 ``` vim mod_utils.F ``` 按“i”进入编辑模式，将其中的ISNAN函数修改为“IEEE USENAN”。 按“Esc”键，输入:wq!，按“Enter”保存并退出编辑。 11. 执行以下命令编译安装FVCOM主程序。 ``` make ``` 安装成功后，可使用ll命令在当前目录查看生成的可执行文件“fvcom”。