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title: 安装依赖“broom”失败
description: "提示类似ERROR：dependencies‘stringr’，‘ggplot2’ are not available for package ‘broom’报错。"
url: https://www.hikunpeng.com/document/detail/zh/kunpenghpcs/hpcindapp/trouble/bootkit_hpc_troublecase_0199.html
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# 安装依赖“broom”失败

#### 问题现象描述

提示类似ERROR：dependencies‘stringr’，‘ggplot2’ are not available for package ‘broom’报错。


#### 关键过程、根本原因分析

在安装MWASTools过程中，因网络超时或依赖版本与Bioconductor不匹配等原因安装依赖“broom”的子依赖“stringr”和“ggplot2”失败，会导致依赖“broom”安装失败。


#### 结论、解决方案及效果

方法一：通过命令BiocManager::install("stringr")和BiocManager::install("ggplot2")优先安装依赖“broom”的子依赖“stringr”和“ggplot2”。这2个子依赖安装完成后，再输入命令BiocManager::install("broom")安装依赖“broom”。

方法二：如果通过方法一依然安装失败，可以通过手动源码安装，根据安装过程中提示的报错获取stringr的源码地址。将stringr的源码下载到服务器，通过命令R CMD INSTALL xxxxx.tar.gz安装。