--- title: 安装HIO桥接目标库 description: "HIO通过桥接目标库来实现应用加速，目前支持加速的应用如表1所示。为了确保实现HIO加速应用，请按照表1选择安装应用运行所需的HIO桥接目标库。" url: https://www.hikunpeng.com/document/detail/zh/kunpenghpcs/hpckit/instg/KunpengHPCKit_install_023.html sourcePath: /source/zh/kunpenghpcs/hpckit/instg/KunpengHPCKit_install_023.html indexId: 773af0f820853d3e02353a3679a3a59ff15871dfacc07adc9221fa0eba0da8e866 --- # 安装HIO桥接目标库 HIO通过桥接目标库来实现应用加速，目前支持加速的应用如表1所示。为了确保实现HIO加速应用，请按照表1选择安装应用运行所需的HIO桥接目标库。 **表1 应用版本和目标库映射关系** | 应用名称 | 版本 | HIO桥接目标库 | | --- | --- | --- | | WRF | 4.2.2版本 | libpnetcdf.so | | NEMO | 版本30Nov20 | libnetcdf.so | | Grapes | CMA\_GFS\_3.3版本3.3 CMA\_MESO版本5.1 | libmpi.so | | LAMMPS | 4.2版本 | libhdf5.so或libpnetcdf.so | | QE | 6.4.1版本 | libhdf5.so | #### 安装libhdf5.so 1. 下载hdf5源码压缩包hdf5-1.12.3.tar.gz(https://hdf-wordpress-1.s3.amazonaws.com/wp-content/uploads/manual/HDF5/HDF5_1_12_3/src/hdf5-1.12.3.tar.gz)。 2. 使用SFTP工具将hdf5-1.12.3.tar.gz上传服务器，执行以下命令解压。 ``` tar zxf hdf5-1.12.3.tar.gz ``` 3. 编译安装。 a. 执行以下命令进入hdf5源码目录并创建build目录。 ``` cd hdf5-1.12.3 mkdir build ``` b. 执行配置操作。 ``` cd build ``` ``` ../configure --prefix= /path/to/hdf5-install ``` /path/to/hdf5-install表示libhdf5.so的安装目录，建议与2中的目录区分开。 批量安装桥接目标库时，安装目录请参见《Kunpeng HPC Solution 26.1.RC1 LLD模板》(https://support.huawei.com/enterprise/zh/doc/EDOC1100583410)中“项目基本信息 > 共享存储目录规划 > HPCKit安装目录”。 c. 执行以下命令编译。 ``` make -j ``` d. 执行以下命令安装。 ``` make install ``` 4. 执行以下命令检查安装目录确认是否包含hdf5动态库。 ``` ls /path/to/hdf5-install/lib ``` 回显如下说明安装目录下已经存在hdf5动态库，表示安装成功。 1 libhdf5.a libhdf5_hl.a libhdf5_hl.la libhdf5_hl.so libhdf5_hl.so.200 libhdf5_hl.so.200.1.1 libhdf5.la libhdf5.settings libhdf5.so libhdf5.so.200 libhdf5.so.200.3.0 #### 安装libnetcdf.so 1. 下载NetCDF源码压缩包netcdf-c-4.9.2.tar.gz(https://downloads.unidata.ucar.edu/netcdf-c/4.9.2/netcdf-c-4.9.2.tar.gz)。 2. 使用SFTP工具将netcdf-c-4.9.2.tar.gz上传服务器，执行以下命令解压。 ``` tar zxf netcdf-c-4.9.2.tar.gz ``` 3. 编译安装。 a. 执行以下命令进入NetCDF源码目录并创建build目录。 ``` cd netcdf-c-4.9.2 mkdir build ``` b. 执行配置操作。 ``` cd build ``` ``` ../configure --prefix= /path/to/netcdf-install ``` /path/to/netcdf-install表示libnetcdf.so的安装目录，建议与2中的目录区分开 批量安装桥接目标库时，安装目录请参见《Kunpeng HPC Solution 26.1.RC1 LLD模板》(https://support.huawei.com/enterprise/zh/doc/EDOC1100583410)中“项目基本信息 > 共享存储目录规划 > HPCKit安装目录”。 c. 执行以下命令编译。 ``` make -j ``` d. 执行以下命令安装。 ``` make install ``` 4. 执行以下命令检查安装目录确认是否包含NetCDF动态库。 ``` ls /path/to/netcdf-install/lib ``` 回显如下说明安装目录下已经存在NetCDF相关动态库，表示安装成功。 1 libnetcdf.a libnetcdf.la libnetcdf.settings libnetcdf.so libnetcdf.so.19 libnetcdf.so.19.2.2 pkgconfig #### 安装libpnetcdf.so 1. 下载PnetCDF源码压缩包pnetcdf-1.12.1.tar.gz(https://parallel-netcdf.github.io/Release/pnetcdf-1.12.1.tar.gz)。 2. 使用SFTP工具将pnetcdf-1.12.1.tar.gz上传服务器，执行以下命令解压。 ``` tar zxf pnetcdf-1.12.1.tar.gz ``` 3. 编译安装。 a. 进入PnetCDF源码目录并创建build目录。 ``` cd pnetcdf-1.12.1 mkdir build ``` b. 执行配置操作。 ``` cd build ``` ``` export MPICC= /opt/HPCKit /latest /hmpi/gcc/release/hmpi/bin /mpicc ``` ``` ../configure --prefix= /path/to/pnetcdf-install --enable-shared ``` /path/to/pnetcdf-install表示libpnetcdf.so的安装目录，建议与2中的目录区分开。 /opt/HPCKit表示HPCKit安装目录。 批量安装桥接目标库时，安装目录请参见《Kunpeng HPC Solution 26.1.RC1 LLD模板》(https://support.huawei.com/enterprise/zh/doc/EDOC1100583410)中“项目基本信息 > 共享存储目录规划 > HPCKit安装目录”。 c. 执行以下命令编译。 ``` make -j ``` d. 执行以下命令安装。 ``` make install ``` 4. 执行以下命令检查安装目录确认是否包含PnetCDF动态库。 ``` ls /path/to/pnetcdf-install/lib ``` 回显如下说明安装目录下已经存在PnetCDF相关动态库，表示安装成功。 1 libpnetcdf.a libpnetcdf.la libpnetcdf.so libpnetcdf.so.4 libpnetcdf.so.4.0.1 pkgconfig #### 配置HIO桥接目标库的环境变量 - 如果HIO桥接目标库在usr/lib64下已存在，则不用配置环境变量，其他情况都需要配置环境变量。 - 如果多个桥接库不在同一目录下，需要对每个桥接库分别配置环境变量。 - 以下通过为LD_LIBRARY_PATH配置libpnetcdf.so的环境变量为例说明。 - 用find命令查找HIO桥接目标库所在目录，将该目录配置到环境变量。 - 仅对当前会话生效： ``` export LD_LIBRARY_PATH= /path/to/pnetcdf-install/ lib : $LD_LIBRARY_PATH ``` - 对当前用户生效： 1. 执行以下命令，进入~/.bashrc文件。 ``` vim ~ /.bashrc ``` 2. 按“i”进入编辑模式，在文件~/.bashrc末尾增加如下命令行。 ``` export LD_LIBRARY_PATH= /path/to/pnetcdf-install / lib : $LD_LIBRARY_PATH ``` 3. 按“ESC”退出编辑模式，然后输入":wq!"保存并退出。 4. 执行以下命令，使配置立即生效。 ``` source ~ /.bashrc ```