介绍
HH-suite是一个开源软件包,用于基于隐马尔可夫模型(HMM)的成对比对进行敏感蛋白质序列搜索。它包含HHsearch和HHblits以及其他程序和实用程序。HHsearch将多序列比对(MSA)或配置文件HMM作为输入,并在HMM数据库(例如PDB、Pfam或InterPro)中搜索同源蛋白质。HHsearch通常用于蛋白质结构预测,以检测同源模板并为同源建模构建高度准确的查询模板配对比对。
关于HH-suite的更多信息请访问HH-suite相关网站。
语言:C/C++/Perl。
一句话描述:远程蛋白质同源性检测套件。
开源协议:GPL-3.0。
建议的版本
建议使用的版本为“HH-suite v3.3.0”。